Перейти к содержанию
Forensic medical forum
Судебно-медицинский форум
Авторизация  
Кузьмич

Исследование гнилостных бактерий. Статья

Рекомендуемые сообщения

Наткнулся тут на статью американских коллег.

статья

В машинном переводе корявенько, но читаемо.

Основные моменты: Ребята решили озаботиться изучением микрофлоры в гниющем трупе с использованием ДНК идентификации. Говорят, что те известные бактерии, которые участвуют в гниении трупа-это совсем не те. Вернее, только малая толика. Потому как их изучали и определяли путем посевов. А не каждая микрофлора захочет расти в чашке Петри. Им натур-продукт подавай. Оформив кучу разрешений, положили техасской осенью на лобное место они аж два трупа. Один, 62 года алкоголик и инфарктник, другой- чуть помоложе, умер от отравления угарным газом. Смотрели как трупы зеленеют и пухнут и периодически брали пробы из рта и попы. Причем, в попе оказалось бактерий больше, чем во рту 8(/> И размножались они там лучше :)/> В статье есть таблицы, графики как росли бактерии. Выводы в статье такие: в гниении участвуют не только бактерии, которых мы знаем, но и куча других. Их можно ДНК идентифицировать. И по их росту можно судить о давности смерти. Но для этого надо протушить еще много трупов, а потом уже можно что-то говорить о закономерностях.

Поделиться сообщением


Ссылка на сообщение
Поделиться на другие сайты

Это они с дисбактериозом не исследовали или нашего бомжа после технаря, фиг бы что у мерикосов выросло бы :shoot:/>

Поделиться сообщением


Ссылка на сообщение
Поделиться на другие сайты

Просто еще одно приложение технологии секвенирования ДНК следующего поколения (NGS). Ее сейчас пихают во все места. С бактериями всё достаточно просто, за один раз можно установить видовой и количественный состав микробиоты в образце. В форензик приложения есть следующие:

1) Установление тканевого происхождения биол. следов. Выявлены специфичные бактериальные маркеры слюны, вагинального секрета и фекалий. Некоторые включены в мультиплексные ПЦР системы для идентификации тканей, которые применяются в реальных экспертизах, представляемых в суде, в частности в Новой Зеландии.

2) Есть работы по установлению географического и возможно этнического происхождения по анализу бактериального состава потожирового следа (отпечатка пальца). Есть еще очень масштабный проэкт по изучению микробиоты человеческого тела, в частности, выявлены бакт. сообщества характерные для разных участков кожного покрова. Т.е. в принципе есть возможность установить каким именно местом потожировой след был оставлен (лбом или :(/> ).

3) Изучение индивидуальных микробиот выявило их уникальность для каждого человека, т.е. профиль бакт. ДНК может быть использован для идентификации личности с той же эффективностью как отпечатки пальцев. Более того, есть группо-специфичные профили, т.е. можно по бактериям установить этническое происхождение.

 

Ну вот, что вспомнил, может что-то упустил. Ясен пень, что число переменных, влияющих на состав бактерий огромно, их еще изучать и изучать, но первые рез-ты как ни странно обнадеживают: оказывается специфичные индивидуальные и групповые сообщества бактерий не так-то легко вывести из гомеостаза, несмотря на перемену диеты, образа жизни и многие заболевания с приемом медикаментов.

Что касается данной статьи, то почему бы и нет. Энтомология достаточно широко используется для определения ДНС, может и бактериология полезной окажется, когда не два трупа, а две сотни изучат.

 

ЗЫ: анекдот с трупами, оставленными на лужайке вспомнил. Попалась как-то статья, что-то вроде "характерные повреждения трупов животных, причиняемые газонокосилкой", что за бред думаю, оказалось авторы заложили эксперимент по изучению разложения трупов. На специальной лужайке в высокой траве разместили свиные туши и стали ждать, когда они разлагаться начнут. Но как-то так вышло, что садовника предупредить забыли и он по этой лужайке газонокосилкой проехался. Пришлось им срочно название статьи менять :shoot:/>

Поделиться сообщением


Ссылка на сообщение
Поделиться на другие сайты

"технологии секвенирования ДНК следующего поколения (NGS). Ее сейчас пихают во все места." А может именно в этом великая сермяжная правда? Точно этническое, а не географическое, т.е у афроавстралопитека, родившегося во глубине сибирских руд профиль бактерий тот же, что и у его родной бабки, слезшей с дерева в малой Пизундии на реке Конго? Ой, не верую, что то генетики не то...., бабки просют...

Поделиться сообщением


Ссылка на сообщение
Поделиться на другие сайты

"технологии секвенирования ДНК следующего поколения (NGS). Ее сейчас пихают во все места." А может именно в этом великая сермяжная правда? Точно этническое, а не географическое, т.е у афроавстралопитека, родившегося во глубине сибирских руд профиль бактерий тот же, что и у его родной бабки, слезшей с дерева в малой Пизундии на реке Конго? Ой, не верую, что то генетики не то...., бабки просют...

Совершенно не хочу этот подход защищать, есть более другие методы, куда как эффективнее, чем секвенирование бактерий. Но, есть наследуемые этнические различия в биохимии и физиологии, которые обуславливают определенный характерный состав бактерий. Так что вполне возможно, что микофлора некоего афророссиянина, выросшего в СФО, будет сильно отличаться от микрофлоры его соседей, но по ряду позиций напоминать микрофлору его конголезских родичей.

Поделиться сообщением


Ссылка на сообщение
Поделиться на другие сайты

Так что вполне возможно, что микофлора некоего афророссиянина, выросшего в СФО, будет сильно отличаться от микрофлоры его соседей, но по ряду позиций напоминать микрофлору его конголезских родичей.

Так возможно, или доказано, как говорят - таки большая разница.

Поделиться сообщением


Ссылка на сообщение
Поделиться на другие сайты

Спасибо, интекуресно. Не по профилю, но в лекции курвсантам вставлю облизательно :shoot:/> Блин, во дает лженаука. Падла Хрущев, как мы отстали :(/>

Изменено пользователем prostofil

Поделиться сообщением


Ссылка на сообщение
Поделиться на другие сайты

Однажды в лесу, близ швейцарского замка Невшатель темной-темной ночью люди в белых одеяниях разбросали трупы трех пристреленных свиней. Черные слухи поползли по городу...

 

В общем, примерно так начинался полевой эксперимент по установлению возможности определения ДНС по изменению видового состава почвенных простейших в условиях лиственного леса (Can soil testate amoebae be used for estimating the time since death? A field experiment in a deciduous forest).

Результаты оказались достаточно обещающими: оказалось, что через 20-30 дней из почвы под свиными трупами полностью исчезали раковинные амебы - простейшие, в обычных условиях очень многочисленные в почве березово-дубового леса (106-108 особей на кв. метр). Со временем, сообщество простейших восстанавливалось, однако, это процесс занимал более 10 месяцев (я так понял, далее наблюдения просто не велись). Авторы полагают, что анализ простейших может оказаться полезным для установления ДНС, особенно на больших интервалах (>4-6 недель), когда даже энтомологические методы становятся ненадежными.

 

 

 

http://files.mail.ru/14A0EDB19A6444F08ECF70D9CCE329E3

Поделиться сообщением


Ссылка на сообщение
Поделиться на другие сайты
оказалось, что через 20-30 дней из почвы под свиными трупами полностью исчезали раковинные амебы - простейшие, в обычных условиях очень многочисленные в почве березово-дубового леса (106-108 особей на кв. метр). Со временем, сообщество простейших восстанавливалось, однако, это процесс занимал более 10 месяцев (я так понял, далее наблюдения просто не велись). Авторы полагают, что анализ простейших может оказаться полезным для установления ДНС, особенно на больших интервалах (>4-6 недель), когда даже энтомологические методы становятся ненадежными.

это все не шаманизм, а довольно достоверные данные

но, увы, мы (судебные медики) тут открываем велосипед

классическими биологами эти факты достаточно изучены, вопросы биоценоза они разрабатывают столетиями, в том числе и в таких случаях

Изменено пользователем Доктор Немо

Поделиться сообщением


Ссылка на сообщение
Поделиться на другие сайты

классическими биологами эти факты достаточно изучены, вопросы биоценоза они разрабатывают столетиями, в том числе и в таких случаях

Авторы про это и пишут. Оказывается, этих амеб биологи много где используют в кач-ве индикаторов.

Ну дык, форензик сайнс вторична и есть, наверное как и многие другие прикладные науки.

Поделиться сообщением


Ссылка на сообщение
Поделиться на другие сайты

Идея интересна. Но вот как ее в практику загнать? Да и наша ли это компетенция?

 

Очевидно мы можем только намекнуть следователю о заоблачных вершинах науки Швейцарии.

Поделиться сообщением


Ссылка на сообщение
Поделиться на другие сайты

Идея интересна. Но вот как ее в практику загнать? Да и наша ли это компетенция?

 

Очевидно мы можем только намекнуть следователю о заоблачных вершинах науки Швейцарии.

Это компетенция почвоведов, благо у нас и кафедр соответствующих полно и целых факультетов. Для них определить видовой состав - рутинная задача, никакой заоблачной науки здесь нет :)/>

 

Кстати, наверно и генетикой можно задачу решить, почему бы и нет. Как бактерий анализируют по 16S rRNA, простейших можно по 18S идентифицировать.

Ну да, как раз так и делают: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23038176

Так что, давите на Павла Леонидовича, пускай запускает секвенирование сообществ, бактериальных и протистов ;)/>

Изменено пользователем genosys

Поделиться сообщением


Ссылка на сообщение
Поделиться на другие сайты
Это компетенция почвоведов, благо у нас и кафедр соответствующих полно и целых факультетов. Для них определить видовой состав - рутинная задача, никакой заоблачной науки здесь нет
А кто будет интерпретировать результаты с приложением к давности захоронения?

 

Птостите за невежество: А кто есть Павел Леонидович?

Поделиться сообщением


Ссылка на сообщение
Поделиться на другие сайты

А кто будет интерпретировать результаты с приложением к давности захоронения?

Честно говоря, я не в курсе как оно все в бСССР организовано. Энтомологические экспертизы ДНС как-то же проводятся?

 

Птостите за невежество: А кто есть Павел Леонидович?

Главный судебный генетик Всея РФ :)/>

Поделиться сообщением


Ссылка на сообщение
Поделиться на другие сайты
Главный судебный генетик Всея РФ
, а периферия. Я участвую в естественно отборе в Ураине :)/>

 

 

Честно говоря, я не в курсе как оно все в бСССР организовано. Энтомологические экспертизы ДНС как-то же проводятся?
У нас на обум Лазаря и то, я даже таковых давно не встречал. Однако, будем иметь в виду. Спасибо за инфу.

Поделиться сообщением


Ссылка на сообщение
Поделиться на другие сайты

Еще одно приложение исследования ДНК микрофлоры. На сей раз предлагают идентифицировать образцы почвы по видовому составу обитающих в ней бактерий, простейших, растений и пр., используя технологию ДНК секвенирования следующего поколения.

 

The environmental biological signature: NGS profiling for forensic comparison of soils

 

Abstract

The identification of the source of a specific soil sample is a crucial step in forensic investigations. Rapid advances in next generation sequencing (NGS) technology and the strong reduction of the cost of sequencing have recently opened new perspectives. In the present work a metabarcoding approach has been successfully applied to forensic and environmental soil samples, allowing the accurate and sensitive analysis of microflora (mfDNA), plants, metazoa, and protozoa DNA. The identification of the biological component by DNA metabarcoding is a strong element for the discrimination of samples geologically very similar but coming for distinct environments.

 

(если вдруг понадобится полный текст, стучитесь в личку)

Поделиться сообщением


Ссылка на сообщение
Поделиться на другие сайты

Для публикации сообщений создайте учётную запись или авторизуйтесь

Вы должны быть пользователем, чтобы оставить комментарий

Создать учетную запись

Зарегистрируйте новую учётную запись в нашем сообществе. Это очень просто!

Регистрация нового пользователя

Войти

Уже есть аккаунт? Войти в систему.

Войти
Авторизация  



×