Забор проб для генотипирования. Проблемы контаминации.

Чувствительность современных методов исследования биологических следов для нужд идентификации индивидуума потрясает. Спросил на днях нашего зав. лаба геномки, тот важно напыжился и сообщил, что теоретически достаточно двух клеток. Проверить это выссказывание не могу, да и он наверное тоже, но, видимо, действительно не много надо чтобы достаточное количество ДНК для пробы набрать.

Несомненно радостное с точки зрения криминиластики, известие, но что оно обозначает на практике? Как известно, палка - о двух концах. Если двух клеток для анализа достаточно, то и для того, чтобы контаминировать объект много не потребуется. В конце 90-х годов прошлого столетия после того, как наша первая институтская лаборатория по генетике плавно выросла из биологического отделения и начала проводить генетическое типизирование на потоке возникли и первые проблемы.

В объектах стали попадаться смешанные следы. Что вообще-то нормально, так как следы на объектах могут и несколько человек оставить. Но заподозрил завлаб, что следы-то от судебных медиков, а не от подозреваемых и прочих преступников. Собрали собрание коллектива и попросили сдать каждого на анализ мазок из ротовой полости на ДНК. Большинство проникшись проблемой согласились. Лаборатория определила каждому сотруднику генотип и стала его искать в каждой пробе.

И действительно выяснилось, что несколько раз сотрудники института каким-то образом контаминировали объекты. Причин выявили несколько.

1. В лаборатории по геномке работали милые лаборантки, которые любили приглашать в гости лаборанток из других лабораторий, ну там кофею попить и поболтать по душам, как это в любых лабораториях принято. Чего там эти гости делали в точности не понятно, но видимо ходя по лаборатории они оставляли свои генетические следы на лабораторных столах, полу, дверных ручках. Не исключено, что и воздушно-капельным путём при чихании и кашле. Погода у нас сырая всё же, отсюда тотальная сопливость сотрудников.

Этуп роблему решили быстро. Запретили всем посторонним посещать геномную лабораторию.

2. На вскрытии каким-то образом попадала ДНК вскрывальщиков (санитаров и докторов) на объекты. Тут было решено, что наверное кто-то из сотрудников голыми руками за пробирки брался.

Купили особые пробирки и настращали всех на предмет правильного забора в чистых перчатках.

3. Третьим источником контаминации вычислили случайные падения объектов на пол или лабораторный стол. Завлаб провёл несколько пробных исследований и выяснил, что стоит объекту (штанам) в лаборатории упасть из рук лаборантки на пол, как вся сторона, которой объект на пол лёг становится непригодной практически для исследования. То же и с недеконтаминированным столом.

Тут опять настращали лаборанток и заставили регулярно столы деконтаминировать и работать на разрезанном пластиковом мешке в котором пробы доставили.

4. И совсем экзотический источник контаминации вычитали мы из прессы. Оказалось, что многие годы полиция забирала пробы на геномку стерильными ватными палочками. Но на этих палочках была ДНК сотрудницы фармаконцерна, которая где-то там на конвейере их упаковывала. Её ДНК обнаружили в более чем 10 убийствах в разных регионах страны. Думали, поначалу, что ищут особо опастную рецидивистку-террористку, которая и полицейских убивала, а оказалось, что палочки грязные были.

В связи с этим по всех стране провели в полиции шмон и заставили купить новые ватные палочки.

Нашли фирму в Швейцарии, которая гарантирует не стерильность палочек, а то, что они свобдны от ДНК. Об этом есть пометка и на упаковке "DNA free", а внизу пояснено "нельзя получить ДНК - профиль". Prionics AG, Wagistr. 27a, 8952 Swiss www.prionics.com. Tel. +41 44 200 2000.

Сделано всё просто. Пластиковая пробирка с пробкой в которой деревянная палочка фиксирована, на конце которой вата. Пробка защищена наклейкой с перфорацией с двумя номерами. При открывании пробирки верхний номер остаётся на пробке, а нижний на пробирке. Т.е. всегда можно по номеру принадлежность пробки и пробирки проверить.

Есть пометка, что пробу не требуется замораживать и можно хранить при обычной температуре. Внутри пробирки на дне пластиковый стаканчик, который пробу фиксирует.
Просто и понятно всё, но стоит каждая пробирка примерно 1,5 €